Isto não deve demorar muito...
Clica nos botões que queres usar no jogo e, depois de realçados, carrega na tecla que queres usar para controlar a direcção do jogador, o disparo, etc.
No meu jogo só queremos esquerda, direita, saltar e disparar, por isso só preciso de definir essas teclas e deixo as restantes como estão.
Agora vamos precisar de escrever código que controle como o jogador se move, ou seja, o que acontece quando se carrega nas teclas que acabámos de definir.
Felizmente, o MPAGD consegue escrever algum código inicial por ti. No menu Tools selecciona Script Generator...